Vor Ort in Israel und Palästina arbeitet EAPPI unter anderem mit den folgenden Organisationen zusammen:
Machsom Watch: Organisation israelischer Frauen, die Checkpoints (hebr.: machsom) beobachten und ihre Beobachtungen dokumentieren und veröffentlichen.
Rabbiner für Menschenrechte: Von Rabbinern gegründete und unterstützte Organisation, welche die palästinenisches Zivilbevölkerung zum Beispiel durch Anwesenheit bei der Olivenernete solidarisch unterstützt und Öffentlichkeitsarbeit betreibt.
Breaking the Silence: Gruppe ehemalige Soldaten, die Zeugnis über ihre Dienstzeit ablegen und vor allem die israelische Öffentlichkeit über das Verhalten der israelischen Armee in der Westbank aufklären wollen.
Israelisches Kommittee gegen Hauszerstörungen (ICAHD): israelische Organisation, die politisch und juristisch gegen die Zerstörung der Häuser der palästinensischen Zivilbevölkerung in Ostjerusalem und der Westbank aktiv ist.
Combants for Peace: Gruppe ehemalige israelischer SoldatInnen und palästinensischer "FreiheitskämpferInnen", die neue Wege der Verständigung gehen und damit den Kreislauf der Gewalt durchbrechen wollen.
